تعد مادة الرياضيات أهم مادة بالنسبة لتلاميذ السنة الثانية باكالوريا علوم رياضية، وتهدف إلى توسيع مدارك ومكتسبات التلميذ التي قام بتحصيلها خلال السنوات الماضية. ويضم برنامج مادة الرياضيات مسلك العلوم الرياضية دروسا أكثر تعمقا مقارنة بالشعب الأخرى، وينقسم إلى قسمين:
- التحليل؛ ويهدف إلى دراسة الدوال و المتتاليات العددية واعتمادها كأداة رياضية في حل المسائل ( البحث عن المطاريف، مقارنة الصيغ التحليلية، الحل الهندسي للمتراجحات و المعادلات، التأطير، التقريب…)
- الجبر و الهندسة؛ يمازج هذا الفصل بين الدراسة الجبرية و الدراسة الهندسية من خلال اعتماد مجموعة من الدروس من قبيل: الحسابيات، الأعداد العقدية، حساب الاحتمالات، البنيات الجبرية…